owl是什么
OWL(Web Ontology Language)是W3C开发的一种网络本体语言,用于对本体进行语义描述。由于OWL是针对各方面的需求在DAML+0IL 的基础上改进而开发的,所以一方面要保持对DAML+0IL/RDFS的兼容性,另一方面又要保证更加强大的语义表达能力,同时还要保证描述逻辑(DL,Description Logic)的可判定推理,因此,W3C的设计人员针对各类特征的需求制定了三种相应的OWL的子语言,即OWL Lite、OWL DL和OWL Full,而且各子语言的表达能力递增[5]。 OWL Lite是表达能力最弱的子语言。
1、它是OWL DL的一个子集,但是通过降低OWL DL中的公理约束,保证了迅速高效的推理。
2、它支持基数约束,但基数值只能为0或l。
3、因为OWL Lite表达能力较弱,为其开发支持工具要比其他两个子语言容易一些。
4、OWL Lite用于提供给那些仅需要一个分类层次和简单约束的用户[6,7]。
5、 OWL DL(Description Logic,描述逻辑)将可判定推理能力和较强表达能力作为首要目标,而忽略了对RDFS的兼容性。
6、OWL DL包括了OWL语言的所有语言成分,但使用时必须符合一定的约束,受到一定的限制。
7、OWL DL提供了描述逻辑的推理功能,描述逻辑是OWL的形式化基础。
8、 OWL Full包含OWL的全部语言成分并取消了OWL DL中的限制,它将RDFS扩展为一个完备的本体语言,支持那些不需要可计算性保证(no computational guarantees)但需要最强表达能力和完全自由的RDFS用户[6]。
9、在OWL Full中,一个类可以看成是个体的集合,也可以看成是一个个体。
10、由于OWL Full取消了基数限制中对可传递性质的约束,因此不能保证可判定推理。
11、 OWL是一个非冗余的蛋白质序列数据库,是由Leeds大学和Warrington的Daresbury实验室合作开发的(Bleasby等,1994)。
12、OWL数据库由四个主要的一级序列数据库复合而成,即SWISS-PROT、PIR、GenBank(由其编码序列翻译而成的氨基酸序列)和NRL-3D。
13、在构建OWL数据库的过程中,考虑到每个数据库所包含序列信息的情况,赋予它们不同的优先级,SWISS-PROT数据库的优先级最高。
14、在对数据的处理上,不仅删除与某一序列完全相同的序列条目,也剔除与某一序列相差个别氨基酸残基的序列条目。
15、因此,OWL数据库是一个具有较小冗余度的蛋白质序列数据库。
16、尽管如此,与NRDB相同,OWL数据库也会有一些错误,即在该数据库中仍然包括来自一次数据库的错误序列,例如由GenBank中错误序列翻译而得的错误的氨基酸序列。
17、此外,OWL数据库更新较慢。
18、英国的EMBnet国家节点上提供有针对于OWL的BLAST搜索服务。
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